激光原子力显微镜观察肌动蛋白体外自组织纤维结构多态性的初步研究

1 　材料和方法

1. 1 　材料

    G-actin 提取自牛骨骼肌,纯化按照Spudich 和Watt 等人的方法[25 ] 。分离的肌动蛋白达电泳单点纯,储存于4 ℃的G-缓冲液中备用;Na2ATP、DTT 购自Sigma ,Tris-base 、Tris-HCl 购自Promega , 其余试剂均为国产分析纯;CSPM-2000we 型原子力显微镜为中国科学院化学研究所本原纳米仪器有限公司生产,使用NANOPROBETM NP 型Si3N4 探针。

1. 2 　方法

1. 2. 1 　溶液配制　G-缓冲液( 2mmolPL Tris-Cl ,pH7. 5 , 0. 2mmolPL CaCl2 , 0. 5mmolPL DTT , 0. 2mmolPL ATP) 和F-缓冲液(5mmolPL Tris-Cl , pH7. 5 , 2mmolPLMgCl2 , 100mmolPL KCl , 1mmolPL DTT , 1mmolPLATP) 均按常规方法制备,所有使用的溶剂和新鲜配制的溶液均通过<0. 22μm 的滤膜过滤去除颗粒。

1. 2. 2 　待测样品制备　用F-缓冲液将1ml 纯化G-actin 精确稀释至100ml ,使溶液中G-actin 的最终浓度为5μgPml ,然后将样品置于37 ℃恒温箱中孵育30min 使其聚合。聚合完成后,在新鲜剥离的云母表面滴加5μl 待测溶液,使其自然脱水制成待测样品。

1. 2. 3 　原子力显微镜成像　样品制备完成后不经过任何物理和化学处理,立即在室温下(25 ℃) 用原子力显微镜的接触模式成像。原子力显微镜采集的图像保存为BMP 格式,储存在电脑中做进一步的分析。上述所有操作均在超净工作条件下进行,以避免污染。

2 　结果

2. 1 　树状分支结构的纤维丛

    肌动蛋白在体外通过自组织能够聚合形成离散的、具有典型分形结构特征的树状分支纤维丛结构,但不能形成大区域的连续网络结构(Fig. 1) ;与微丝稳定剂鬼笔环肽存在时,形成由单根微丝和微丝束组成的、大范围的连续交联网络结构明显不同[24 ] 。

    实验中,肌动蛋白通过自组织形成的树状分支纤维丛由多级纤维分支形成,次级纤维成份间的相互作用和微丝动力学过程的动态平衡可能是树状分支结构产生的必要条件,但详细的聚合动力学机制还有待进一步的研究。

2. 2 　不同直径的纤维结构

    肌动蛋白可通过自组织过程聚合形成不同直径(7nm～35nm) 的长纤维,实验中观察到的最细纤维的结构参数与单根无鬼笔环肽结合时的F-actin[19 ]一致(Fig. 2 a) ;此外,还有大量具有较大直径和分支结构的纤维出现,表明有不同于单根微丝和微丝束的高级纤维结构产生(Fig. 2 b～d) 。但高级纤维结构的构成模式还有待深入研究,初步判断观察到的高级结构可能是由若干单根微丝经过(多级) 螺旋或其它构成方式形成的有序结构。

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Fig. 1 　Tree-like branch structure with fractal features.
The structure seems to be composed of multiple order helix filaments with branches , which actually indicate the possible mechanism for formation of high order actin filaments by self-organization.

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Fig. 2 　Filaments with different diameters.
(a) The slimmest single filament is most similar to F-actin in size with ～7 nm width at half height and ～35 nmpitch ; (b) the filaments have much wider diameter than the slimmest F-actin ; (c) The branch filament could be con-stituted of two enlaced slimmer filaments , forming the branch in the joining point of another filament ; (d) Two fila-ments are aligned side by side , and thought that there might exist certain interaction between them , which could be theearly step for further assembly of giant filaments. The unit of scale ruler is nm.

2. 3 　自组织纤维结构的3D-重建

    利用计算机3D成像技术对自组织纤维结构进行了3D 构建以获取有用的表面结构细节,结果表明不同类型的纤维结构具有类似的表面构象和拓扑性质,提示各种类型的纤维结构可能来源于相同的聚合动力学过程。

2. 3. 1 　树状分支结构的3D-重建　对树状分支结构的纤维丛局部区域进行了3D-重建,发现其表面存在明显的螺纹结构(Fig. 3) ,表明粗纤维可能由更细的构成成份缠绕螺旋而成;但分支节点的结构还未能清晰地解析,其构成方式需进一步研究。

2. 3. 2 　长纤维结构的3D-重建　从长纤维结构的3D-重建图中,可观察到不同直径的纤维表面存在与树状分支结构表面类似的螺纹结构( Fig. 4) 。虽然长纤维结构和分支结构具有不同的表观形态,但是二者在构成方式、聚合动力学过程以及有序结构多态性形成的分子机制上可能存在本质的联系。

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Fig. 3 　3D-reconstruction of branch structure.The spiral flight can be clearly observed on the fila-ments surface , which demonstrates that the giant fila-ments could come from the thinner filament by intertwist-ing with one another in self-organization dynamics. Theunit of scale ruler is nm.

3 　讨论

    实验表明,作为微丝工具药物而广泛应用的鬼笔环肽可能对体外肌动蛋白大尺度聚合结构有较大的影响。在体外简单热力学体系中,肌动蛋白自组织为单纯的、无干预的热力学过程,完全受其内在的热力学特性所驱动。利用肌动蛋白聚合动力学的踏车模型可以较好地对肌动蛋白自组织行为进行定性的分析:在F-缓冲液中,肌动蛋白的聚合过程在经过成核期、生长期之后能够迅速进入动态平衡。此时,结合态的纤维型肌动蛋白残基与游离的球型肌动蛋白含量保持动态平衡。微丝的总体长度处于相对恒定的状态,受总长度的限制,单根微丝长度有限,微丝间的相互作用较难发生,形成交联的几率很小,因此在自组织过程中,肌动蛋白难以聚合形成连续的交联网络纤维结构,只能形成离散的纤维结构;在微丝稳定剂(如鬼笔环肽) 介入时,肌动蛋白聚合在经过成核期进入生长期之后,肌动蛋白体外自装配由于微丝解聚合过程被抑制而受到干预,正常的聚合P解聚合动态平衡受到破坏,导致自装配向聚合单方向进行,使溶液中的游离肌动蛋白和寡聚体浓度很低, 此时几乎所有的肌动蛋白均聚合为微丝,微丝的总长度接近最大,单根微丝相对较长,彼此之间的相互作用较易发生,因而容易形成大范围的交联网络结构。

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Fig. 4 　3D-reconstruction of two parallel filaments with different diameters. On the surface of the filaments , similar topological and conformational structure traits can be discerned ;suggesting that all the filaments observed in the experi-ment could result from the same thermodynamic process.The unit of scale ruler is nm.

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作者简介

张　军:男,1973 年10 月17 日出生,四川南充人,博士研究生。重庆医科大学任教,从事细胞生物学、生物物理与生物化学领域科研工作。已有7 篇学术论文被SCI , Medline , CA等国际检索系统收录。

Biography

ZHANG Jun : male , born in the 17th of October 1973. He is a Ph D graduate and also teaches in the Chongqing University of Medical Sciences , majoring in cell biology , biochemistry and biophysics. He has published 7 articles that have been cited by SCI , Medline and CA.© 1995-2005 Tsinghua Tongfang Optical Disc Co., Ltd. All rights reserved.

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